線路共有路線

I 　都営地下鉄三田線　　Toei Subway Mita Line　

目黒〜白金高輪間で線路を共有しています。

直通運転路線

MG 　東急目黒線　　Tokyu Meguro Line　

直通区間：目黒(MG01)～日吉(MG13)

南北線の南側終点の目黒からは、多くの列車が東急目黒線に直通運転し、終点の日吉まで運行しています。目黒線内は「各駅停車」か「急行」のいずれかで運転します。

SR 　埼玉スタジアム線　　Saitama Stadium Line　

直通区間：赤羽岩淵(SR19)～浦和美園(SR26)

南北線の北側終点の赤羽岩淵からは、多くの列車が埼玉高速鉄道埼玉スタジアム線に直通運転し、終点の浦和美園まで運行しています。

都心を南北に横断する南北線は、全線開業が2000年(平成12年)と比較的新しく、東京では11番目に出来た地下鉄です(全線開通は9番目)。上記の路線図ではナンバリング順で記載している関係で南が上に、北が下に表記しています。新しい路線の為、駅のホームには「フルスクリーンタイプ」と呼ばれる大きいホームドアを使用しており、線路上に降りられないようになっています。北側では埼玉高速鉄道線に直通、南側では東急目黒線に直通し、それぞれ終点まで運転しています。都営三田線とは目黒〜白金高輪間で線路を共有しています。

基本種別　

　急行　　Express　

　└東急目黒線直通　

　各停　　Local　

南北線内は全列車各駅に停車します。

急行は目黒から東急目黒線内を急行運転します。